Chính sách thuế trường mầm non tư thục đóng vai trò quan trọng trong việc đảm bảo các cơ sở giáo dục vận hành hợp pháp, tối ưu hóa chi phí và tận dụng các ưu đãi từ Nhà nước. Việc nắm rõ các quy định về thuế giúp các trường tránh được rủi ro pháp lý, đồng thời đóng góp vào sự phát triển bền vững của hệ thống giáo dục. Cùng ACC Đồng Nai khám phá để đảm bảo tuân thủ pháp luật và phát triển hiệu quả.

1. Chính sách thuế trường mầm non tư thục hiện nay

Việc hiểu rõ các quy định về thuế là yếu tố then chốt để trường mầm non tư thục vận hành đúng quy định và tận dụng các chính sách ưu đãi.

Lệ phí môn bài là khoản phí bắt buộc đối với các tổ chức, cá nhân hoạt động sản xuất, kinh doanh, bao gồm cả trường mầm non tư thục được thành lập dưới hình thức doanh nghiệp hoặc cơ sở giáo dục. Theo Nghị định 139/2016/NĐ-CP, các trường mầm non tư thục phải nộp lệ phí môn bài hàng năm, trừ năm đầu tiên được miễn. Mức lệ phí được xác định dựa trên vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư ghi trong giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh. Cụ thể, vốn điều lệ trên 10 tỷ đồng chịu mức lệ phí 3.000.000 đồng/năm, từ 10 tỷ đồng trở xuống là 2.000.000 đồng/năm, và các chi nhánh hoặc địa điểm kinh doanh chịu mức 1.000.000 đồng/năm. Trường hợp quyết định thành lập không ghi rõ vốn điều lệ, trường cần phối hợp với Phòng Giáo dục và Đào tạo địa phương để xác định mức lệ phí phù hợp. Việc nộp lệ phí môn bài đúng hạn giúp trường tránh các khoản phạt hành chính, đảm bảo tuân thủ quy định tại Luật Quản lý thuế 2019.

Thuế giá trị gia tăng (GTGT) là một loại thuế quan trọng cần được xem xét kỹ lưỡng. Theo Thông tư 69/2025/TT-BTC, các khoản thu từ hoạt động dạy học, nuôi giữ trẻ, bao gồm cả tiền ăn và chi phí đưa đón học sinh, thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT. Điều này có nghĩa là các trường mầm non tư thục không phải lập tờ khai thuế GTGT cho các khoản thu này, giúp giảm gánh nặng hành chính. Tuy nhiên, các khoản thuế GTGT đầu vào (từ việc mua sắm thiết bị, tài sản cố định, hoặc dịch vụ) chỉ được khấu trừ nếu liên quan đến hoạt động chịu thuế GTGT. Do đó, các trường cần thiết lập hệ thống kế toán rõ ràng, lưu trữ hóa đơn đầu vào và đầu ra cẩn thận để đảm bảo tuân thủ quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, có hiệu lực từ ngày 1/7/2025.

Thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) áp dụng dựa trên lợi nhuận của trường mầm non tư thục. Theo Điểm a, Khoản 3 Điều 19 Thông tư 78/2014/TT-BTC, các cơ sở giáo dục thực hiện xã hội hóa, bao gồm trường mầm non tư thục, có thể được hưởng thuế suất ưu đãi 10% trong suốt thời gian hoạt động nếu đáp ứng các điều kiện tại Quyết định 1470/QĐ-TTg năm 2016. Các điều kiện này bao gồm duy trì quy mô tối thiểu 50 trẻ liên tục trong 3 năm, diện tích sử dụng tối thiểu 8m2/trẻ ở khu vực thành phố và 12m2/trẻ ở khu vực nông thôn hoặc miền núi, đồng thời tuân thủ Điều lệ trường mầm non theo Quyết định 14/2008/QĐ-BGDĐT. Nếu không đáp ứng, trường sẽ chịu thuế suất thông thường 20% theo Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2008, được sửa đổi bởi Luật 71/2014/QH13. Ngoài ra, các trường mới thành lập có thể được miễn thuế TNDN trong 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 5-9 năm tiếp theo, tùy thuộc vào địa bàn hoạt động (đặc biệt khó khăn hoặc không), theo Nghị định 218/2013/NĐ-CP. Việc tận dụng ưu đãi này đòi hỏi trường phải chuẩn bị hồ sơ đầy đủ và đáp ứng các tiêu chí kiểm tra từ cơ quan thuế.

Thuế thu nhập cá nhân (TNCN) áp dụng đối với các trường mầm non tư thục do cá nhân làm chủ hoặc các khoản thu nhập của giáo viên, nhân viên. Theo Công văn 7069/CT-TTHT năm 2010, nếu trường không thực hiện đầy đủ chế độ kế toán hoặc không có hóa đơn, thuế TNCN sẽ được tính theo tỷ lệ phần trăm trên doanh thu, dựa trên Quyết định 16334/CT-QĐ ngày 30/12/2008. Tuy nhiên, từ ngày 1/1/2026, theo Điều 17 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, các hộ, cá nhân kinh doanh có doanh thu dưới 200 triệu đồng/năm sẽ không phải nộp thuế TNCN, thay vì mức 100 triệu đồng/năm hiện tại theo Luật Thuế thu nhập cá nhân 2007, được sửa đổi bởi Luật 71/2014/QH13. Các trường cần đảm bảo kê khai chính xác thu nhập của nhân viên, khấu trừ tại nguồn theo Thông tư 111/2013/TT-BTC, và lưu trữ hồ sơ để tránh vi phạm. Việc thuê dịch vụ tư vấn thuế chuyên nghiệp có thể giúp đơn giản hóa quy trình này.

2. Điều kiện để hưởng ưu đãi thuế cho trường mầm non tư thục

Để được hưởng các chính sách ưu đãi thuế, trường mầm non tư thục cần đáp ứng các điều kiện nghiêm ngặt.

Theo Nghị định 69/2008/NĐ-CP về khuyến khích xã hội hóa, các trường mầm non tư thục muốn hưởng ưu đãi thuế phải thuộc danh mục loại hình, tiêu chí quy mô, tiêu chuẩn được ban hành kèm theo Quyết định 1470/QĐ-TTg năm 2016. Cụ thể, trường cần duy trì quy mô tối thiểu 50 trẻ liên tục trong 3 năm, với số trẻ tối đa mỗi lớp theo độ tuổi: 15 trẻ (3-12 tháng), 20 trẻ (13-24 tháng), 25 trẻ (25-36 tháng và 3-4 tuổi), 30 trẻ (4-5 tuổi), và 35 trẻ (5-6 tuổi). Diện tích sử dụng tối thiểu là 8m2/trẻ ở khu vực thành phố và 12m2/trẻ ở khu vực nông thôn hoặc miền núi. Ngoài ra, trường phải tuân thủ Điều lệ trường mầm non theo Quyết định 14/2008/QĐ-BGDĐT, bao gồm các quy định về cơ sở vật chất (phòng học, khu vui chơi, thiết bị dạy học), đội ngũ giáo viên (trình độ chuyên môn, tỷ lệ giáo viên/trẻ), và chương trình giáo dục được phê duyệt bởi Bộ Giáo dục và Đào tạo. Các trường đáp ứng các điều kiện này có thể được hưởng thuế suất TNDN 10% trong suốt thời gian hoạt động, miễn thuế TNDN 4 năm kể từ khi có thu nhập chịu thuế, và giảm 50% số thuế phải nộp trong 5-9 năm tiếp theo, tùy thuộc vào địa bàn hoạt động.

Việc đáp ứng các điều kiện trên đòi hỏi các trường mầm non tư thục phải có kế hoạch đầu tư và vận hành bài bản. Hồ sơ chứng minh điều kiện ưu đãi cần bao gồm báo cáo quy mô học sinh, bản vẽ thiết kế cơ sở vật chất, danh sách giáo viên với bằng cấp liên quan, và chương trình giáo dục được phê duyệt. Theo Thông tư 156/2013/TT-BTC, cơ quan thuế có quyền kiểm tra và yêu cầu bổ sung hồ sơ để xác minh điều kiện hưởng ưu đãi. Nếu trường không đáp ứng, cơ quan thuế có thể truy thu thuế và áp dụng phạt hành chính, với mức phạt từ 20% đến 100% số thuế truy thu, tùy thuộc vào mức độ vi phạm. Do đó, việc phối hợp với các đơn vị tư vấn pháp lý hoặc kế toán chuyên nghiệp là cần thiết để đảm bảo tuân thủ và tối ưu hóa lợi ích.

>>> Xem thêm tại đây Dịch vụ tư vấn thuế tại Đồng Nai uy tín, chuyên nghiệp

Xem thêm: 1Mẫu báo cáo quyết toán sử dụng biên lai thuế chi tiết2>Mẫu báo cáo quyết toán sử dụng biên lai thuế chi tiết

3. Thủ tục kê khai và nộp thuế cho trường mầm non tư thục

Quy trình kê khai và nộp thuế là bước quan trọng để trường mầm non tư thục tuân thủ pháp luật và tránh rủi ro. Dưới đây là các bước cụ thể, dựa trên các quy định tại Luật Quản lý thuế 2019 và các văn bản liên quan.

Bước 1: Đăng ký mã số thuế và kê khai lệ phí môn bài

Sau khi được cấp phép thành lập theo Nghị định 46/2017/NĐ-CP, trường mầm non tư thục cần đăng ký mã số thuế tại cơ quan thuế địa phương trong vòng 10 ngày kể từ ngày được cấp giấy phép. Theo Điều 10 Luật Đất đai 2024, trường cần đảm bảo sử dụng đất đúng mục đích (đất giáo dục) để tránh bị thu hồi hoặc xử phạt. Sau khi có mã số thuế, trường phải kê khai và nộp lệ phí môn bài trước ngày 30/1 hàng năm, trừ năm đầu tiên được miễn theo Nghị định 139/2016/NĐ-CP. Hồ sơ kê khai bao gồm tờ khai lệ phí môn bài (theo mẫu 01/LPMB), quyết định thành lập, và giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh. Trường hợp quyết định thành lập không ghi rõ vốn điều lệ, trường cần phối hợp với Phòng Giáo dục và Đào tạo để cung cấp thông tin bổ sung, đảm bảo xác định đúng mức lệ phí.

Bước 2: Kê khai thuế TNDN và TNCN

Trường mầm non tư thục phải tự xác định điều kiện hưởng ưu đãi thuế TNDN theo Thông tư 78/2014/TT-BTC và Quyết định 1470/QĐ-TTg. Hồ sơ kê khai thuế TNDN bao gồm tờ khai thuế (theo mẫu 03/TNDN), báo cáo tài chính, và các tài liệu chứng minh điều kiện xã hội hóa (quy mô học sinh, diện tích sử dụng, chương trình giáo dục). Đối với thuế TNCN, trường cần kê khai thu nhập của giáo viên và nhân viên theo Thông tư 111/2013/TT-BTC, đảm bảo khấu trừ tại nguồn hoặc nộp theo tỷ lệ doanh thu nếu không có hóa đơn đầy đủ. Từ ngày 1/1/2026, theo Điều 17 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, các cá nhân kinh doanh có doanh thu dưới 200 triệu đồng/năm sẽ không phải nộp thuế TNCN, giúp giảm gánh nặng cho các trường quy mô nhỏ. Các tờ khai thuế TNDN và TNCN phải được nộp đúng hạn, thường là hàng quý hoặc hàng năm, tùy thuộc vào quy mô và phương pháp kê khai được đăng ký.

Bước 3: Quản lý hóa đơn và sổ sách kế toán

Để đảm bảo tuân thủ quy định tại Luật Kế toán 2015, các trường mầm non tư thục cần thiết lập hệ thống kế toán minh bạch. Các khoản thu chi, hóa đơn đầu vào và đầu ra cần được lưu trữ cẩn thận để phục vụ kiểm tra từ cơ quan thuế. Theo Công văn 96/TCT-CS, nếu trường không thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, cơ quan thuế có thể áp dụng phương pháp tính thuế theo tỷ lệ doanh thu, dẫn đến nguy cơ bị truy thu thuế. Việc sử dụng phần mềm kế toán hoặc thuê dịch vụ kế toán chuyên nghiệp có thể giúp trường quản lý hiệu quả các giao dịch tài chính, đảm bảo tuân thủ quy định tại Thông tư 88/2014/TT-BTC về hóa đơn điện tử.

Bước 4: Kiểm tra và quyết toán thuế

Cơ quan thuế định kỳ kiểm tra hoặc thanh tra để xác minh điều kiện hưởng ưu đãi thuế và tính chính xác của số thuế kê khai. Theo Thông tư 156/2013/TT-BTC, trường cần cung cấp đầy đủ hồ sơ, bao gồm sổ sách kế toán, hóa đơn, và tài liệu chứng minh quy mô, tiêu chuẩn. Nếu phát hiện sai phạm, trường có thể bị truy thu thuế và phạt hành chính, với mức phạt từ 0,03% đến 0,1% số thuế chậm nộp mỗi ngày, theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP. Để tránh rủi ro, trường nên phối hợp chặt chẽ với cơ quan thuế và chuẩn bị hồ sơ đầy đủ, đặc biệt là các tài liệu chứng minh điều kiện hưởng ưu đãi thuế.

4. Câu hỏi thường gặp

Dưới đây là các câu hỏi phổ biến liên quan đến chính sách thuế trường mầm non tư thục, kèm câu trả lời chi tiết dựa trên các văn bản pháp luật hiện hành:

Trường mầm non tư thục có phải nộp thuế GTGT không?

Các khoản thu từ hoạt động dạy học, nuôi giữ trẻ, bao gồm tiền ăn và chi phí đưa đón học sinh, thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT theo Thông tư 69/2025/TT-BTC. Tuy nhiên, các khoản thu khác (như bán hàng hóa chịu thuế) phải kê khai thuế GTGT. Trường cần quản lý hóa đơn đầu vào, đầu ra cẩn thận để đảm bảo hạch toán chính xác và tuân thủ Luật Thuế giá trị gia tăng 2024.

Làm thế nào để được hưởng thuế suất TNDN 10%?

Trường phải đáp ứng các điều kiện tại Quyết định 1470/QĐ-TTg năm 2016, bao gồm quy mô tối thiểu 50 trẻ liên tục trong 3 năm, diện tích sử dụng từ 8-12m2/trẻ tùy khu vực, và tuân thủ Điều lệ trường mầm non theo Quyết định 14/2008/QĐ-BGDĐT. Hồ sơ chứng minh cần được lưu trữ đầy đủ để cơ quan thuế kiểm tra, đảm bảo hưởng thuế suất ưu đãi 10% theo Thông tư 78/2014/TT-BTC.

Trường mới thành lập có được miễn thuế TNDN không?

Theo Thông tư 78/2014/TT-BTC và Nghị định 218/2013/NĐ-CP, trường mới thành lập trong lĩnh vực giáo dục xã hội hóa được miễn thuế TNDN 4 năm kể từ khi có thu nhập chịu thuế và giảm 50% trong 5-9 năm tiếp theo, tùy địa bàn. Trường cần tự kê khai và cung cấp hồ sơ chứng minh điều kiện xã hội hóa để được hưởng ưu đãi.

Lệ phí môn bài được nộp khi nào và ở đâu?

Lệ phí môn bài phải được nộp trước ngày 30/1 hàng năm tại cơ quan thuế địa phương, trừ năm đầu tiên được miễn theo Nghị định 139/2016/NĐ-CP. Mức phí dao động từ 1.000.000 đến 3.000.000 đồng/năm, tùy thuộc vào vốn điều lệ hoặc vốn đầu tư, theo Luật Quản lý thuế 2019.

Chính sách thuế trường mầm non tư thục là yếu tố cốt lõi giúp các cơ sở giáo dục vận hành hợp pháp, tận dụng ưu đãi, và tối ưu hóa chi phí. Việc nắm rõ các quy định về lệ phí môn bài, thuế GTGT, thuế TNDN, và thuế TNCN, cùng với việc đáp ứng các điều kiện ưu đãi, sẽ giúp trường tránh rủi ro pháp lý và phát triển bền vững. Để được hỗ trợ chi tiết về thủ tục kê khai, hồ sơ pháp lý, và các vấn đề liên quan, hãy liên hệ ACC Đồng Nai ngay hôm nay để nhận tư vấn chuyên nghiệp.