Dịch vụ y tế có chịu thuế gtgt không là một trong những thắc mắc phổ biến của các cơ sở y tế và doanh nghiệp liên quan, đặc biệt khi ngành y tế đang phát triển mạnh mẽ tại Việt Nam. Việc nắm rõ quy định này không chỉ giúp tránh rủi ro pháp lý mà còn tối ưu hóa chi phí hoạt động, đảm bảo tuân thủ đúng luật thuế. Cùng ACC Đồng Nai tìm hiểu chi tiết qua bài viết dưới đây.

1. Theo luật dịch vụ y tế có chịu thuế GTGT không?

Dịch vụ y tế có chịu thuế GTGT không là câu hỏi được đặt ra nhiều trong bối cảnh Luật Thuế giá trị gia tăng năm 2024 được ban hành và chính thức có hiệu lực từ ngày 01/07/2025, với nhiều thay đổi mang tính nền tảng đối với nhóm dịch vụ y tế. Việc xác định đúng bản chất chịu thuế hay không chịu thuế không chỉ ảnh hưởng đến nghĩa vụ kê khai thuế mà còn tác động trực tiếp đến chi phí dịch vụ và giá thành cung ứng cho người dân.

Theo điểm a khoản 10 Điều 5 Luật Thuế giá trị gia tăng năm 2024, các dịch vụ y tế phục vụ cho con người được xếp vào nhóm đối tượng không chịu thuế GTGT. Quy định này bao trùm toàn bộ hoạt động khám bệnh, chữa bệnh, phòng bệnh cho người, dịch vụ sinh đẻ có kế hoạch, điều dưỡng sức khỏe, phục hồi chức năng, cũng như các dịch vụ chăm sóc người cao tuổi, người khuyết tật. Như vậy, kể từ ngày 01/07/2025, về nguyên tắc chung, dịch vụ y tế không còn thuộc diện chịu thuế GTGT như trước đây.

Luật Thuế GTGT 2024 không phân biệt dịch vụ y tế do cơ sở công lập hay tư nhân cung cấp, mà xác định căn cứ vào bản chất dịch vụ. Chỉ cần dịch vụ mang tính chất y tế theo quy định của pháp luật chuyên ngành và phục vụ trực tiếp cho việc chăm sóc sức khỏe con người thì thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT, bất kể đơn vị cung cấp là bệnh viện công, bệnh viện tư, phòng khám hay cơ sở y tế khác được cấp phép hoạt động hợp pháp.

2. Các quy định chi tiết về đối tượng chịu thuế GTGT trong lĩnh vực y tế

Mặc dù dịch vụ y tế cốt lõi thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT theo Luật Thuế GTGT 2024, nhưng không phải mọi hoạt động phát sinh trong lĩnh vực y tế đều mặc nhiên được miễn trừ nghĩa vụ thuế. Việc xác định đối tượng chịu thuế vẫn cần căn cứ cụ thể vào từng loại dịch vụ, từng khoản thu và mối quan hệ với hoạt động khám chữa bệnh.

• Nhóm dịch vụ y tế không chịu thuế GTGT

Theo điểm a khoản 10 Điều 5 Luật Thuế GTGT 2024, nhóm dịch vụ không chịu thuế bao gồm dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh, phòng bệnh cho người; dịch vụ sinh đẻ có kế hoạch; điều dưỡng sức khỏe; phục hồi chức năng; chăm sóc người cao tuổi, người khuyết tật; vận chuyển người bệnh; cho thuê phòng bệnh, giường bệnh; các hoạt động xét nghiệm, chiếu, chụp; máu và chế phẩm máu sử dụng cho người bệnh. Đối với các gói dịch vụ chữa bệnh theo quy định của Bộ Y tế, nếu trong gói có bao gồm tiền thuốc chữa bệnh thì khoản thu từ tiền thuốc này cũng thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

• Các hoạt động phát sinh không mang bản chất dịch vụ y tế

Những hoạt động tuy phát sinh trong cơ sở y tế nhưng không trực tiếp phục vụ cho việc khám, chữa bệnh hoặc chăm sóc sức khỏe con người thì không thuộc phạm vi điều chỉnh của khoản không chịu thuế nêu trên. Trường hợp cơ sở y tế cung cấp dịch vụ mang tính kinh doanh độc lập như bán thực phẩm chức năng, mỹ phẩm, dịch vụ thẩm mỹ không nhằm mục đích điều trị, hoặc cho thuê mặt bằng kinh doanh thì các khoản doanh thu này vẫn thuộc diện chịu thuế GTGT theo mức thuế suất tương ứng.

• Phân biệt dịch vụ y tế và dịch vụ thú y

Luật Thuế GTGT 2024 đồng thời xác định dịch vụ thú y, bao gồm khám bệnh, chữa bệnh, phòng bệnh cho vật nuôi, cũng thuộc nhóm không chịu thuế GTGT. Tuy nhiên, việc áp dụng cần phân biệt rõ với các dịch vụ chăm sóc thú cưng mang tính thương mại cao, không gắn với mục tiêu phòng chống dịch bệnh theo quy định chuyên ngành, để tránh áp dụng sai chính sách thuế.

>> Đọc thêm: Dịch vụ hoàn thuế GTGT tại Đồng Nai

3. Trường hợp miễn thuế GTGT đối với dịch vụ y tế và cách áp dụng

Việc xác định dịch vụ y tế thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT không đồng nghĩa với việc cơ sở y tế không cần quan tâm đến nghĩa vụ thuế. Trên thực tế, cách áp dụng quy định này đòi hỏi cơ sở y tế phải hiểu đúng bản chất “không chịu thuế” và thực hiện đúng chế độ hóa đơn, kế toán theo quy định pháp luật.

Theo Luật Thuế GTGT 2024, dịch vụ y tế thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT, tức là không phát sinh thuế GTGT đầu ra. Đồng thời, thuế GTGT đầu vào liên quan trực tiếp đến hoạt động cung cấp dịch vụ y tế không được khấu trừ mà phải tính vào chi phí hoặc giá trị tài sản theo quy định của pháp luật kế toán và thuế.

Để áp dụng đúng quy định không chịu thuế GTGT, cơ sở y tế phải chứng minh dịch vụ cung cấp đúng phạm vi dịch vụ y tế theo Luật Thuế GTGT 2024 và pháp luật chuyên ngành y tế. Hoạt động phải được thực hiện bởi cơ sở có giấy phép hành nghề, giấy phép hoạt động theo quy định của Luật Khám bệnh, chữa bệnh. Khoản thu phải phát sinh trực tiếp từ dịch vụ y tế, không bị tách rời hoặc “thương mại hóa” dưới hình thức khác.

Khi cung cấp dịch vụ y tế thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT, cơ sở y tế vẫn phải lập hóa đơn theo quy định của pháp luật về hóa đơn, trong đó dòng thuế suất và tiền thuế GTGT được ghi rõ là “không chịu thuế GTGT”. Việc lập hóa đơn đúng bản chất giúp tránh rủi ro bị cơ quan thuế ấn định thuế hoặc xử phạt do xác định sai nghĩa vụ thuế.

Trong thực tế, nhiều cơ sở y tế nhầm lẫn giữa dịch vụ y tế không chịu thuế và dịch vụ chịu thuế suất 0% hoặc 10%, dẫn đến kê khai sai, hạch toán sai chi phí và bị truy thu thuế. Việc hiểu sai khái niệm “không chịu thuế” cũng có thể khiến doanh nghiệp áp dụng khấu trừ thuế đầu vào không đúng quy định, phát sinh tranh chấp với cơ quan thuế khi thanh tra, kiểm tra.

>> Đọc thêm: Dịch vụ tư vấn thuế tại Đồng Nai uy tín, chuyên nghiệp

4. Tác động của thuế GTGT đến hoạt động kinh doanh dịch vụ y tế

Việc dịch vụ y tế được xếp vào nhóm không chịu thuế GTGT từ ngày 01/07/2025 tạo ra những tác động đa chiều đối với hoạt động tài chính, kế toán và chiến lược giá của các cơ sở y tế, đặc biệt là khối tư nhân.

• Tác động đến giá dịch vụ và khả năng tiếp cận y tế

Do không phải tính thuế GTGT đầu ra, giá dịch vụ y tế về nguyên tắc sẽ không bị “đội” thêm yếu tố thuế, qua đó góp phần giảm chi phí trực tiếp cho người bệnh. Điều này đặc biệt có ý nghĩa trong bối cảnh chi phí y tế ngày càng gia tăng và nhu cầu chăm sóc sức khỏe của người dân ngày càng cao.

• Tác động đến chi phí và hạch toán của cơ sở y tế

Ngược lại, việc không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào khiến các cơ sở y tế phải tính toàn bộ thuế GTGT đầu vào vào chi phí hoạt động. Điều này đòi hỏi cơ sở y tế phải quản trị chi phí chặt chẽ hơn, đặc biệt đối với các khoản đầu tư lớn như trang thiết bị y tế, máy móc, vật tư tiêu hao.

• Tác động đến quản trị thuế và tuân thủ pháp luật

Quy định mới buộc các cơ sở y tế phải rà soát lại toàn bộ mô hình kinh doanh, phân loại rõ từng loại dịch vụ cung cấp để xác định đúng nghĩa vụ thuế. Việc tuân thủ đúng ngay từ đầu giúp hạn chế rủi ro pháp lý, tránh bị xử phạt và góp phần nâng cao tính minh bạch trong hoạt động y tế.

5. Câu hỏi thường gặp

Dịch vụ y tế tư nhân có chịu thuế GTGT từ ngày 01/07/2025 không?

Theo điểm a khoản 10 Điều 5 Luật Thuế GTGT 2024, dịch vụ y tế không phân biệt do cơ sở công lập hay tư nhân cung cấp đều thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT, miễn là đáp ứng đúng bản chất dịch vụ y tế theo quy định pháp luật.

Dịch vụ thẩm mỹ có được coi là dịch vụ y tế không chịu thuế GTGT không?

Chỉ những dịch vụ thẩm mỹ mang tính điều trị, phục hồi chức năng và được thực hiện theo quy định chuyên ngành y tế mới có thể xem xét là dịch vụ y tế. Các dịch vụ thẩm mỹ thuần túy vì mục đích làm đẹp, không phục vụ điều trị bệnh lý, vẫn thuộc diện chịu thuế GTGT theo quy định chung.

Cơ sở y tế lập hóa đơn như thế nào đối với dịch vụ không chịu thuế GTGT?

Cơ sở y tế vẫn phải lập hóa đơn theo quy định, trên hóa đơn ghi rõ dịch vụ không chịu thuế GTGT và không ghi tiền thuế. Việc lập hóa đơn đúng giúp cơ quan thuế dễ dàng kiểm tra và giảm thiểu rủi ro pháp lý cho đơn vị cung cấp dịch vụ.

Dịch vụ y tế có chịu thuế gtgt không là vấn đề then chốt mà mọi cơ sở y tế cần nắm vững để tránh rủi ro pháp lý và tối ưu hóa hoạt động. Việc tuân thủ các quy định từ Luật Thuế giá trị gia tăng số 13/2008/QH12 và Thông tư số 219/2013/TT-BTC không chỉ đảm bảo tuân thủ pháp luật mà còn hỗ trợ phát triển ngành y tế bền vững. Nếu bạn đang gặp khó khăn trong việc áp dụng, hãy liên hệ ACC Đồng Nai ngay hôm nay để nhận tư vấn chuyên sâu và giải pháp hiệu quả.