Trong bối cảnh hội nhập kinh tế toàn cầu, hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu giúp doanh nghiệp tối ưu hóa chi phí và tăng khả năng cạnh tranh. Cùng ACC Đồng Nai, bài viết này cung cấp hướng dẫn chi tiết về thủ tục hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu theo pháp luật Việt Nam.

1. Điều kiện để được hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu

Để được hoàn thuế GTGT, doanh nghiệp phải đáp ứng các điều kiện nghiêm ngặt về pháp lý, kỹ thuật và quy hoạch theo quy định của Luật Quản lý thuế số 2019. Điều kiện này đảm bảo tính minh bạch và hợp pháp của hoạt động xuất khẩu.

Doanh nghiệp cần đăng ký kinh doanh hợp pháp, nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ và có hệ thống kế toán tuân thủ pháp luật. Số thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ phải từ 300 triệu đồng trở lên trong kỳ kê khai (theo tháng hoặc quý). Hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu phải được thực hiện tại địa bàn hoạt động hải quan theo Luật Hải quan 2014. Nếu không đáp ứng, doanh nghiệp có thể bị từ chối hoàn thuế theo Thông tư 40/2025/TT-BTC.

Doanh nghiệp không được vi phạm các hành vi như trốn thuế, gian lận thương mại hoặc buôn lậu trong vòng 2 năm liên tục. Các hợp đồng xuất khẩu, gia công hoặc ủy thác xuất khẩu phải được lập rõ ràng, kèm chứng từ thanh toán qua ngân hàng. Doanh nghiệp cũng cần lưu ý các yêu cầu về hóa đơn GTGT hợp lệ, đặc biệt với các giao dịch trên 20 triệu đồng.

2. Các loại giấy phép và chứng từ liên quan

Mặc dù không yêu cầu giấy phép riêng cho hoàn thuế GTGT, doanh nghiệp cần chuẩn bị các chứng từ pháp lý liên quan để chứng minh hoạt động xuất nhập khẩu hợp lệ. Những chứng từ này đóng vai trò như “giấy phép” gián tiếp để đủ điều kiện hoàn thuế.

Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh là bắt buộc để xác nhận tư cách pháp lý. Hợp đồng xuất khẩu, gia công hoặc ủy thác xuất khẩu (nếu có) cần được sao y bản chính, kèm tờ khai hải quan đã thông quan. Trong trường hợp xuất khẩu tại chỗ hoặc vào khu phi thuế quan, biên bản đối chiếu công nợ hoặc hợp đồng ủy thác là cần thiết. Các chứng từ này phải tuân thủ quy định tại Nghị định 70/2025/NĐ-CP.

Thông tư 25/2018/TT-BTC mở rộng đối tượng được hoàn thuế, bao gồm hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu ra nước ngoài hoặc vào khu phi thuế quan, miễn là đáp ứng điều kiện về địa bàn hải quan. Doanh nghiệp cần kiểm tra kỹ các chứng từ để đảm bảo tính hợp lệ, tránh bị từ chối hoàn thuế.

Xem thêm: Cách xác định giá tính thuế GTGT đối với hàng khuyến mại

3. Thủ tục hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu

Thủ tục hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu đòi hỏi doanh nghiệp tuân thủ quy trình nghiêm ngặt, phối hợp với cơ quan thuế và hải quan. Quy trình này được quy định rõ tại Thông tư 40/2025/TT-BTC và Nghị định 70/2025/NĐ-CP.

Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế
Doanh nghiệp chuẩn bị hồ sơ theo quy định, bao gồm:

• Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước (mẫu 01/ĐNHT).
• Tờ khai thuế GTGT hàng tháng hoặc quý, kèm bảng kê hóa đơn, chứng từ.
• Hợp đồng xuất khẩu, gia công hoặc ủy thác xuất khẩu (bản sao có đóng dấu sao y).
• Tờ khai hải quan đã thông quan (mẫu 01-2/HT).
• Chứng từ thanh toán qua ngân hàng, bao gồm thanh toán với đối tác nước ngoài và nội địa (nếu có ủy thác).
• Bảng kê hóa đơn mua vào trên 20 triệu đồng đã thanh toán qua ngân hàng.

Bước 2: Nộp hồ sơ hoàn thuế
Hồ sơ có thể nộp trực tiếp tại Cục Thuế hoặc Chi cục Thuế tại Đồng Nai, hoặc qua hệ thống điện tử theo Quyết định 2790/QĐ-BTC. Doanh nghiệp cần kiểm tra kỹ hồ sơ để tránh bị trả lại do thiếu sót.

Bước 3: Tiếp nhận và xử lý hồ sơ
Cơ quan thuế sẽ thông báo tính hợp lệ của hồ sơ trong 3 ngày làm việc. Hồ sơ được phân loại thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước khi hoàn thuế. Thời gian xử lý từ 10-40 ngày làm việc, tùy thuộc vào loại hình hoàn thuế.

Bước 4: Nhận quyết định hoàn thuế
Cơ quan thuế ban hành quyết định hoàn thuế hoặc thông báo từ chối (nếu không đủ điều kiện). Số tiền hoàn thuế được chuyển vào tài khoản ngân hàng hoặc bù trừ với các khoản thuế phải nộp khác. Doanh nghiệp cần theo dõi sát sao để đảm bảo quy trình hoàn tất đúng hạn.

>>> Xem thêm tại đây Dịch vụ hoàn thuế GTGT tại Đồng Nai

4. Dịch vụ hỗ trợ hoàn thuế GTGT tại ACC Đồng Nai

Sử dụng dịch vụ tư vấn thuế chuyên nghiệp giúp doanh nghiệp tại Đồng Nai thực hiện thủ tục hoàn thuế GTGT nhanh chóng, chính xác và hiệu quả. ACC Đồng Nai cung cấp dịch vụ toàn diện, từ tư vấn pháp lý đến hỗ trợ lập hồ sơ và làm việc với cơ quan thuế.

ACC Đồng Nai có đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm trong lĩnh vực thuế và xuất nhập khẩu, luôn cập nhật các quy định mới nhất như dự thảo sửa đổi Luật Thuế giá trị gia tăng 2024. Dịch vụ bao gồm kiểm tra hồ sơ, tư vấn điều kiện hoàn thuế và đại diện doanh nghiệp làm việc với cơ quan thuế, giúp rút ngắn thời gian xử lý. Các gói dịch vụ linh hoạt, phù hợp với quy mô doanh nghiệp, từ nhỏ đến lớn.

Lợi ích của việc sử dụng dịch vụ tại ACC Đồng Nai bao gồm giảm thiểu rủi ro sai sót, tiết kiệm thời gian và đảm bảo tuân thủ pháp luật. Doanh nghiệp có thể yên tâm tập trung vào hoạt động kinh doanh chính, trong khi các thủ tục phức tạp được xử lý chuyên nghiệp.

5. Câu hỏi thường gặp

Doanh nghiệp nào được hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu?

Doanh nghiệp đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, có số thuế đầu vào chưa khấu trừ từ 300 triệu đồng trở lên và thực hiện xuất khẩu tại địa bàn hải quan hợp lệ được hoàn thuế.

Hồ sơ hoàn thuế GTGT cần những gì?

Hồ sơ bao gồm giấy đề nghị hoàn thuế (mẫu 01/ĐNHT), tờ khai thuế GTGT, hợp đồng xuất khẩu, tờ khai hải quan, chứng từ thanh toán qua ngân hàng và bảng kê hóa đơn trên 20 triệu đồng (sao y bản chính).

Thời gian xử lý hồ sơ hoàn thuế là bao lâu?

Cơ quan thuế xử lý hồ sơ trong 10-40 ngày làm việc, tùy thuộc vào loại hình hoàn thuế (hoàn trước, kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước). Hồ sơ đầy đủ giúp tránh chậm trễ.

Doanh nghiệp có bị từ chối hoàn thuế nếu vi phạm pháp luật?

Có, doanh nghiệp vi phạm trốn thuế, gian lận thương mại hoặc buôn lậu trong 2 năm liên tục sẽ bị từ chối hoàn thuế. Tuân thủ pháp luật là điều kiện tiên quyết.

Thực hiện đúng thủ tục hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu giúp doanh nghiệp tối ưu hóa dòng tiền và tăng khả năng cạnh tranh trên thị trường quốc tế. Tuân thủ Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 và chuẩn bị hồ sơ đầy đủ là chìa khóa để tận dụng quyền lợi thuế. Hãy liên hệ ACC Đồng Nai để được hỗ trợ chuyên nghiệp, đảm bảo quy trình hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu diễn ra suôn sẻ, hiệu quả.