Thuế nhập khẩu thuốc tân dược là yếu tố quan trọng ảnh hưởng đến chi phí và giá thành thuốc tại Việt Nam, đặc biệt trong bối cảnh nhu cầu y tế ngày càng tăng. Bài viết này sẽ cung cấp thông tin chi tiết về mức thuế suất mới nhất, các quy định liên quan và những lưu ý quan trọng cho doanh nghiệp. Cùng ACC Đồng Nai khám phá ngay!

1. Tổng quan về thuế nhập khẩu thuốc tân dược

Thuế nhập khẩu thuốc tân dược là một loại thuế áp dụng cho các sản phẩm dược phẩm nhập khẩu vào Việt Nam, nhằm điều tiết thị trường và bảo vệ sản xuất trong nước. Chính sách thuế này được cập nhật thường xuyên để phù hợp với các hiệp định thương mại tự do (FTA) và nhu cầu phát triển ngành y tế.

Theo các văn bản hướng dẫn như Nghị định 73/2025/NĐ-CP, thuốc tân dược nhập khẩu thuộc nhóm hàng hóa đặc thù, chịu sự quản lý chặt chẽ từ Bộ Y tế và Tổng cục Hải quan. Các doanh nghiệp cần nắm rõ mã HS (Hệ thống hài hòa mô tả và mã hóa hàng hóa) để áp dụng đúng mức thuế suất. Ví dụ, thuốc tân dược thuộc nhóm 30.04 thường có thuế suất ưu đãi từ 0% đến 5%, tùy thuộc vào xuất xứ và loại thuốc. Việc hiểu rõ quy định này giúp doanh nghiệp tránh các rủi ro pháp lý và tối ưu hóa chi phí nhập khẩu.

Hơn nữa, chính sách thuế nhập khẩu thuốc tân dược còn chịu ảnh hưởng từ các hiệp định FTA như Hiệp định Thương mại Hàng hóa ASEAN (ATIGA) hay Hiệp định Đối tác Toàn diện và Tiến bộ xuyên Thái Bình Dương (CPTPP). Những hiệp định này có thể mang lại ưu đãi thuế quan, nhưng doanh nghiệp cần đáp ứng các yêu cầu về xuất xứ hàng hóa (C/O) để được hưởng lợi.

2. Mức thuế suất thuế nhập khẩu thuốc tân dược mới nhất

Theo Quyết định 15/2023/QĐ-TTg, thuốc tân dược thuộc nhóm 30.04 (bao gồm các sản phẩm dùng để phòng hoặc chữa bệnh, đã được đóng gói theo liều lượng) có mức thuế suất thuế nhập khẩu ưu đãi dao động từ 0% đến 5%. Cụ thể, các loại thuốc như nước vô trùng dùng để xông (mã HS 3004.90.20), thuốc sát trùng (mã HS 3004.90.30), hay thuốc chống HIV/AIDS (mã HS 3004.90.82) đều chịu mức thuế suất 5%. Những loại thuốc đặc trị như thuốc điều trị ung thư hoặc các bệnh khó chữa cũng áp dụng mức thuế 5%, nhằm đảm bảo tính cạnh tranh trên thị trường và hỗ trợ người bệnh.

Đối với các sản phẩm dược liệu nhập khẩu dùng để sản xuất thuốc, mức thuế suất thuế giá trị gia tăng (GTGT) là 5%. Doanh nghiệp cần lưu ý rằng các nguyên liệu này phải được Bộ Y tế xác nhận thuộc danh mục dược liệu để được áp dụng đúng thuế suất. Ví dụ, dược liệu nhập khẩu theo Thông tư 48/2018/TT-BYT phải có giấy phép nhập khẩu từ Cục Quản lý Dược.

Ngoài ra, từ ngày 1/7/2025, Nghị định 174/2025/NĐ-CP quy định giảm thuế GTGT từ 10% xuống 8% cho một số hàng hóa và dịch vụ, nhưng thuốc tân dược thuộc nhóm chịu thuế GTGT 5% không thuộc diện giảm thuế này. Điều này đảm bảo tính ổn định trong chính sách thuế đối với dược phẩm, giúp doanh nghiệp dễ dàng dự đoán chi phí.

Xem thêm: Tìm hiểu thuế nhập khẩu ưu đãi là gì?

3. Quy trình kê khai thuế nhập khẩu thuốc tân dược

Việc kê khai thuế nhập khẩu thuốc tân dược đòi hỏi doanh nghiệp tuân thủ nghiêm ngặt các quy định của pháp luật, đặc biệt là Thông tư 38/2015/TT-BTC. Dưới đây là các bước cụ thể để thực hiện quy trình này.

Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ hải quan

Doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ các chứng từ như hợp đồng nhập khẩu, hóa đơn thương mại, phiếu đóng gói (packing list), giấy chứng nhận xuất xứ (C/O) nếu muốn hưởng ưu đãi thuế quan, và giấy phép nhập khẩu từ Bộ Y tế. Các loại thuốc tân dược phải được Cục Quản lý Dược xác nhận đạt tiêu chuẩn trước khi thông quan. Hồ sơ đầy đủ giúp rút ngắn thời gian kiểm tra và tránh các sai sót về thuế.

Bước 2: Đăng ký tờ khai hải quan

Tờ khai hải quan được nộp tại Chi cục Hải quan nơi doanh nghiệp có trụ sở, cơ sở sản xuất, hoặc tại Chi cục Hải quan cửa khẩu nhập hàng. Doanh nghiệp cần kê khai mã HS chính xác theo Danh mục hàng hóa xuất nhập khẩu Việt Nam. Ví dụ, thuốc sát trùng mã HS 3004.90.30 phải được kê khai với thuế suất 5%. Hệ thống hải quan điện tử (VNACCS/VCIS) hỗ trợ doanh nghiệp nộp tờ khai nhanh chóng và chính xác.

Bước 3: Nộp thuế và hoàn tất thủ tục thông quan

Sau khi tờ khai được chấp nhận, doanh nghiệp nộp thuế nhập khẩu và thuế GTGT (nếu có) tại cơ quan hải quan. Thời gian kiểm tra tờ khai thường không quá 8 giờ làm việc đối với hàng hóa thông thường, nhưng với thuốc tân dược, thời gian có thể kéo dài đến 10 ngày do yêu cầu kiểm tra chất lượng từ Bộ Y tế. Sau khi hoàn thành, hàng hóa được thông quan và đưa vào lưu thông.

Bước 4: Lưu trữ hồ sơ và kiểm tra sau thông quan

Doanh nghiệp cần lưu trữ toàn bộ hồ sơ nhập khẩu trong ít nhất 5 năm để phục vụ kiểm tra sau thông quan. Theo Thông tư 39/2018/TT-BTC, cơ quan hải quan có thể yêu cầu bổ sung chứng từ hoặc giải trình nếu phát hiện sai lệch về thuế suất hoặc mã HS. Việc lưu trữ cẩn thận giúp doanh nghiệp tránh các hình phạt hành chính từ 4-8 triệu đồng theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

>> Xem thêm: Dịch vụ tư vấn thuế tại Đồng Nai uy tín, chuyên nghiệp

4. Câu hỏi thường gặp

Làm thế nào để được hưởng thuế suất ưu đãi theo FTA?

Để được hưởng thuế suất ưu đãi theo các hiệp định FTA như ATIGA hoặc CPTPP, doanh nghiệp cần cung cấp giấy chứng nhận xuất xứ (C/O) mẫu D hoặc mẫu tương ứng. Theo Nghị định 126/2022/NĐ-CP, hàng hóa phải được nhập khẩu từ các nước thành viên FTA và đáp ứng quy tắc xuất xứ. Doanh nghiệp nên phối hợp với nhà cung cấp để đảm bảo chứng từ hợp lệ.

Thuốc tân dược nhập khẩu có chịu thuế bảo vệ môi trường không?

Theo Luật Thuế bảo vệ môi trường số 57/2010/QH12, thuốc tân dược không thuộc danh mục hàng hóa chịu thuế bảo vệ môi trường, như xăng dầu hay túi nilon. Do đó, doanh nghiệp nhập khẩu thuốc tân dược chỉ cần nộp thuế nhập khẩu và thuế GTGT (nếu có), giúp giảm gánh nặng chi phí.

Làm thế nào để kiểm tra mã HS của thuốc tân dược?

Doanh nghiệp có thể tra cứu mã HS trong Danh mục hàng hóa xuất nhập khẩu Việt Nam hoặc tham khảo Phụ lục I của Thông tư 48/2018/TT-BYT. Ngoài ra, việc tư vấn với cơ quan hải quan hoặc các đơn vị chuyên môn như ACC Đồng Nai sẽ giúp xác định chính xác mã HS và mức thuế suất áp dụng.

Việc nắm rõ mức thuế suất thuế nhập khẩu thuốc tân dược không chỉ giúp doanh nghiệp tuân thủ pháp luật mà còn tối ưu hóa chi phí, đảm bảo cạnh tranh trên thị trường. Để được hỗ trợ chi tiết về thủ tục nhập khẩu hoặc tư vấn pháp lý, hãy liên hệ ACC Đồng Nai để nhận giải đáp chuyên nghiệp và nhanh chóng.